עתירה שהגישה קופת חולים כללית נגד ועדת הבדיקה שהקים משרד הבריאות, חושפת במרומז את הסיבות לעזיבתו של מנכ"ל הקופה, אלי כהן. בין הפרטים העולים מהעתירה ומדברי גורמים המקורבים לקופה, עולה חשד ל"ניסיון להתערב בחוות-דעת מקצועית של שומר סף" ו"מידע שהועבר מסמנכ"ל על קבלת הטבות כספיות, שלאחר בירור והמלצה של הדירקטוריון הושבו על ידי המנכ"ל". הפרשה התחילה בתלונת סמנכ"ל וחשפה דפוסי התנהלות שונים.
העתירה שהוגשה על ידי קופת חולים כללית חושפת שורת אירועים שייתכן ועמדו בבסיס החיכוכים שהובילו לעזיבת המנכ"ל אלי כהן. אחד הנושאים שהוזכרו בעתירה הוא "ניסיון להתערב בחוות-דעת מקצועית של שומר סף באופן שהיה עלול להסב נזק ממשי לכללית". גורם המקורב לקופה הסביר ל"גלובס" כי הדברים נוגעים לחיפוש שטח בדרום להקמת מרכז לוגיסטי. הקב"ט של הכללית לא המליץ על שטח מסוים בשל בעיה ביטחונית וחשש מפשיעה, אך לטענת הגורם, כהן לא קיבל את דעתו ושאל מה דרוש כדי בכל זאת להתקדם, אם כי בסופו של דבר המרכז לא נבנה באותו מקום.
נושא נוסף שעלה בעתירה הוא "מידע שהועבר מסמנכ"ל על קבלת הטבות כספיות, שלאחר בירור והמלצה של הדירקטוריון הושבו על-ידי המנכ"ל". אותו גורם המקורב לכללית פירט כי מדובר במצב שבו כהן "לקח רכב חברה, ובנוסף לקח רכב מפול הרכבים של הכללית, וביקש שהרכב הזה ישמש אותו. בנוסף הוא ביקש החזר על נסיעות ברכבת". הגורם מציין כי למיטב ידיעתו, היה זה אירוע נקודתי ולא דפוס התנהלות מתמשך.
גורם נוסף בכללית אישר ל"גלובס" את הדברים והוסיף כי לטענת כהן, הכללית הרוויחה מהסידור של נסיעה ברכבת, כיוון שהוא עבד בזמן הנסיעה. אולם, מומחה חיצוני ששכרה הכללית קבע כי מדובר בהטבה כפולה. בעקבות זאת, התבקש כהן להשיב לכללית כ-17 אלף שקל בעבור הנסיעה ברכבת. בעניין הרכב הכפול, הוחלט שלא לחייבו בהחזר כספי, אלא לרענן את הנהלים בלבד.
נושא נוסף שנדון בעתירה הוא אי-קידום החלטה של הדירקטוריון. לפי שני הגורמים, כהן נמנע מיישום של תוכנית להקצאת כספים לפרויקט מסוים. "הוא לא האמין בדרך הזו, אז הוא מסמס את זה", מספר אחד מהם, "ואז גם דיבר מאוד לא יפה, כשזה עלה בישיבה של הדירקטוריון".
